Typy misji są zróżnicowane; wczesne misje koncentrują się na pozyskaniu kredytów i ekwipunku, przykładem są Liberation Day i The Outlaws. Jedna z misji zawiera serię napadów na pociąg (The Great Train Robbery). Trzecia misja polega na utrzymaniu przyczółku.
Inne misje zawierają, taką w której co pięć minut podnosi się lawa, która wszystko niszczy (The Devil’s Playground); jest też misja, w której zainfekowani terranie atakują w nocy naszą bazę, a w ciągu dnia to my musimy zabić ich jak najwięcej się da (Outbreak); misja, w której trzeba zniszczyć generatory tarcz statku matki, zanim ten zniszczy terrańskie kolonie (Safe Heaven); misje, w której siły terran i zergów starają się przejąć artefakt obcych, z rąk fanatycznych Protossów (Smash and Grab); misja, w której jako samotny „duch” musimy zmienić losy bitwy (Breakout & Ghost of a Chance); misja gdzie na Xel’naga gdzie generatory uszkadzają nasze jednostki (Maw of the Void), misja gdzie trzeba uzbierać 6000 kryształów, by spłacić dług (Cutthroat), misja „Thor” (Engine of Destruction and Media Blitz), oraz misja gdzie jesteśmy ścigani przez fale ognia i musimy ukończyć misję zanim zostaniemy zniszczeni przez pobliską supernovę (Supernova).

